根据威海市工商业联合会（威海市总商会）主要职责，市工商业联合会（市总商会）机关内设2个科。
         (一）综合科。协调机关及直属单位的日常工作；草拟重要文件及领导讲话；负责机关文秘、保密、档案、机要、财务等工作；负责机关及直属单位党群、纪检、人事、劳资工作。宣传党对非公有制经济的方针、政策及工商联在社会主义市场经济体制中的地位、作用；指导、推动基层工商联开展专业知识和生产技术知识培训；组织开展调查研究。负责工商联组织建设，发展会员，维护会员权益；负责同行业公会的日常工作；联系非公有制经济代表人士，发现、培养非公有制经济中的积极分子；参与代表人士政治安排的考察工作；联系指导工商联界政协委员、人大代表的思想政治工作；负责引导会员参加光彩事业和公益事业；负责非公有制经济代表人士的培训；负责工商界生活互助金的使用、管理。
       （二）经济与联络科。负责与市有关经济部门和经济团体的联系；负责为会员提供信息和科技、管理、法律、会计、审计、融资、咨询等服务；配合政府有关部门开展非公有制企业技术监督工作；开展工商专业培训，帮助会员改进经营管理，完善财会管理、照章纳税，提高生产技术和产品质量；为会员提供有关证明，协调关系，调解经济纠纷；管理工商联会办企业、事业。负责与港、澳、台和世界各国工商社团及工商经济界人士的联系，协助会员引进资金、技术、人才；组织会员举办和参加各种对内对外展销会、交易会；组织会员出国、出境考察访问，帮助会员开展国内、国际市场；负责国外商会资料的收集、整理。